http://detail.chiebukuro.yahoo.co.jp/qa/question_detail/q1097762110 
質問者の脳内では

C、D、Eがあって
CドライブにVistaがなぜか2つはいっていて
CドライブをフォーマットしてVistaをインストールしても
最初のVistaが復活していて
パソコンの電源入れたら、どっちか選んで起動する状態

CとDで
デュアルブートになってる
だけだろ
Eにもはいってるかもしれないが

HDDをまるごとフォーマットすればいいじゃねえか